Bioteknologi Perikanan

  Sekstor perikanan adalah sektor ekonomi yang sedang digalakan di seluruh dunia. Permintaan komoditas ikan yang tinggi dan cenderung meningkat dari tahun ke tahun menyebabkan semakin meningkatnya industri perikanan di beberapa negara termasuk Indonesia. Indonesia memiliki wilayah laut yang luas dan perairan daratan yang potensial untuk dikembangkan industri perikanan. Produksi ikan nasional berasal dari ikan tangkap dan hasil budidaya. Kegiatan budidaya ikan secara intensif mulai berkembang di Indonesia seiing dengan meningkatnya permintaan pasar, baik domestik maupun luar negeri. Budidaya ikan air tawar yang sedang popular seperti nila, patin, mujair, lele, mujair dan lain-lain. Saat ini juga sedang digalakan tambak-tambak udang di tepi pantai atau perairan darat, jenis udang yang banyak dibudidauyakan adalah jenis udang vannamei, galah, dan lobster.

Penerapan sistem budidaya intensif dan ramah lingkungan sangat diperlukan guna meningkatkan produksi.  Tingginya angka kematian dan rendahanya konversi pakan (FCR) menyebabkan menurunya produksifitas. Tingginya angka kematian seringkali disebabkan oleh faktor cuaca atau penyakit. Faktor cuaca yang ekstrim seperti hujan yang terus menerus dan suhu yang dingin seringkali menjadi penyebab kegagalan panen pada budidaya udang vannamei. Selain itu, faktor penyebabkan kematian juga dapat disebabkan oleh racun amoniak dan nitrit hasil sisa pakan dan juga limbah berbahaya yang mencemari lingkungan. Untuk menekan angka kematian, para pelaku usaha budidaya perikanan umumnya menggunakan bahan obat-obatan kimia. Penggunaan obat-obatan kimia memang mampu secara efektif menekan berkembangnya penyakit, namun disisi lain efek negatifnya adalah residu bahan kimia pada kimia dapat menjadi masalah kesehatan bagi manusia. Di beberapa negara maju sudah mulai mensyaratkan komoditi ikan yang masuk ke negaranya harus bebas residu kimia. Oleh karena itu pentingnya para pembudidaya perikanan di Indonesia untuk menerapkan best aquaculture practices dalam sertifikasi produk akuakultur yang diekspor, mensyaratkan praktek akuakultur yang ramah lingkungan.

Perkembangan teknologi akuakultur saat ini perlu memfokuskan pada upaya budidaya perikanan yang ramah lingkungan. Saat ini para pembudidaya sudah mulai memanfaatkan mikroba probiotik untuk menekan bakteri pathogen dan memperbaiki kondisi lingkungan air (bioremediasi). Penggunaan probiotik untuk sektor perikanan cukup efektif untuk menekan tingkat kematian dan meningkatkan produksi. Beberapa jenis mikroba mampu meningkatkan konversi pakan (FCR) seperti golongan Lactobacillus. Beberapa jenis mikroba juga mampu menetralisir racun amoniak dan nitrit sisa pakan yang dapat membunuh ikan, beberapa jenis mikroba jenis ini antara lain adalah Nitrobacter, Nitrosomonas, dll. Amoniak (NH3) merupakan hasil dari katabolisme protein dalam tubuh organisme akuatik yang tidak terionisasi melalui insang. Amoniak mengandung unsure Nitrogen dan Hidrogen. Nitrogen dalam sistem akuakultur terutama berasal dari pakan buatan yang biasanya mengandung protein dengan kisaran 13 - 60% (2 - 10% N) tergantung pada kebutuhan dan stadia organisme yang dikultur (Avnimeleeh & Ritvo, 2003; Gross & Boyd 2000; Stickney, 2005). Dari total protein yang masuk ke dalam sistem budidaya, sebagian akan dikonsumsi oleh organisme budidaya dan sisanya terbuang ke dalam air. Protein dalam pakan akan dicerna namun hanya 20 - 30% dari total nitrogen dalam pakan dimanfaatkan menjadi biomasa ikan (Brune et al., 2003).

Beberapa jenis mikroba mampu merombak limbah menjadi bioflock yang dapat menjadi sumber pakan ikan. Penelitian dan penerapan Biofloc adalah sejak tahun 1941 pada pengolahan air limbah di Amerika, untuk mensubtitusi penggunaan plankton.  Bioflok atau Flok merupakan istilah bahasa slang dari istilah bahasa baku “Activated Sludge” (“Lumpur Aktif”) yang diadopsi dari proses pengolahan biologis air limbah (biological wastewater treatment). Salah satu ciri khas bakteri pembentuk bioflocs adalah kemampuannya untuk mensintesa senyawa Poli hidroksi alkanoat ( PHA ), terutama yang spesifik seperti poli β‐hidroksi butirat. Senyawa ini diperlukan sebagai bahan polimer untuk pembentukan ikatan polimer antara substansi substansi pembentuk bioflocs.  Bioflocs terdiri atas partikel serat organik yang kaya akan selulosa, partikel anorganik berupa kristal garam kalsium karbonat hidrat, biopolymer (PHA), bakteri, protozoa, detritus (dead body cell), ragi, jamur dan zooplankton. Bakteri yang mampu membentuk bioflocs diantaranya:  Zooglea ramigera,  Escherichia intermedia,  Paracolobacterium aerogenoids, Bacillus subtilis, Bacillus cereus, Flavobacterium, Pseudomonas alcaligenes, Sphaerotillus natans, Tetrad dan Tricoda

         Teknologi bioflok merupakan salah satu alternatif baru dalam mengatasi masalah kualitas air dalam akuakultur yang diadaptasi dari teknik pcngolahan limbah domestik secara konvensional (Avnimelech, 2006; de Schryver et al., 2008). Prinsip utama yang diterapkan dalam teknologi ini adalah manajemen kualitas air yang didasarkan pada kemampuan bakteri heterotrof untuk memanfaatkan N organik dan anorganik yang terdapat di dalam air. Secara teoritis, pemanfaatan N oleh bakteri heterotrof dalam sistem akuakultur disajikan dalam reaksi kimia berikut (Ebeling et al., 2006):

Secara teoritis untuk mengkonversi setiap gram N dalam bentuk ammonia, diperlukan 6,07 g karbon organik dalam bentuk karbohidrat, 0,86 karbon anorganik dalam bentuk alkalinitas dan 4,71 g oksigen terlarut. Dari persamaan ini juga diperoleh bahwa rasio C/N yang diperlukan oleh bakteri heterotrof adalah sekitar 6.

Kemampuan bioflok dalam mengontrol konsentrasi ammonia dalam sistem akuakultur secara teoritis maupun aplikasi telah terbukti sangat tinggi. Secara teoritis Ebeling et al. (2006) dan Mara (2004) menyatakan bahwa immobilisasi ammonia oleh bakteri heterotrof 40 kali lebih cepat daripada oleh bakteri nitrifikasi. Secara aplikasi de Schryver et al. (2009) menemukan bahwa bioflok yang ditumbuhkan dalam bioreaktor dapat mengkonversi N dengan konsentrasi 110 mg NH4/L hingga 98% dalam sehari. Kondisi yang mendukung pembentukan Bioflocs; Aerasi dan pengadukan (pergerakan air oleh aerator), Karbon dioksida (CO2)

a.        Aerasi dan pengadukan (pergerakan air oleh aerator)

Oksigen jelas diperlukan untuk pengoksidasian bahan organik (COD/BOD), kondisi optimum sekitar 4‐5 ppm oksigen terlarut. Pergerakan air harus sedemikian rupa, sehingga daerah mati arus (death zone) tidak terlalu luas, hingga daerah yang memungkinkan bioflocs jatuh dan mengendap relatif kecil.

b.         Karbon dioksida (CO2)

Karbon dioksida menjadi salah satu kunci terpenting bagi pembentukan dan pemeliharaan bioflocs. Bakteri gram negatif non pathogen seperti bakteri pengoksidasi sulfide menjadi sulfat ( Thiobacillus, photosynthetic bacteria seperti Rhodobacter), bakteri pengoksidasi besi dan Mangan ( Thiothrix ) dan bakteri pengoksidasi ammonium dan ammonia ( Nitrosomonas dan Nitrobacter ) memerlukan karbon dioksida untuk pembentukan selnya, mereka tidak mampu mengambil sumber karbon dari bahan organic semisal karbohidrat, protein atau lemak. Termasuk juga Zooglea, Flavobacterium, tetrad/tricoda dan bakteri pembentuk bioflocs lainnya. Bahkan Bacillus sendiri, sebagai pemanfaat karbon dari bahan organik dan menghasilkan gas karbon dioksida sebagai hasil oksidasinya, memerlukan karbondioksida dalam pernafasan anaerobnya ketika melangsungkan reaksi denitrifikasi.

Jual Aneka Isolat Mikroba

Telp.087731375234

A    

Absidia corymbifera FNCC Aspergillus terreus FNCC    

Acetobacter aceti FNCC Atopobium vaginae ATCC BAA-55    

Acetobacter xylinum FNCC Aspergillus versicolor FNCC    

Achomobachter xylosoxidans subsp. Xylosoxidans ATCC 27061 Aspergillus wentii FNCC    

Acinetobacter baumanni ATCC 19606 Aureobasidium pullulans FNCC    

Acinetobacter baumanni ATCC BAA-747 B    

Acinetobacter Iwoffii ATCC 17925 Bacillus amyloliquefaciens FNCC    

Acinetobacter sp. ATCC 49137 Bacillus amylolyticus FNCC    

Acinetobacter sp. ATCC 49139 Bacillus badius ATCC 14574    

Acinetobacter sp. ATCC 49466 Bacillus cereus ATCC 11778    

Acinetobacter sp. ATCC 9957 Bacillus cereus ATCC 14579    

Actinomyces odontolyticus ATCC 17929 Bacillus cereus FNCC    

Actinomyces viscosus ATCC 15987 Bacillus coagulans FNCC    

Actinomyces viscosus ATCC 43146 Bacillus circulans ATCC 61    

Aerococcus viridans ATCC 11563 Bacillus licheniformis ATCC 12759    

Aerococcus viridans ATCC 700406 Bacillus macerans Schardinger FNCC    

Aeromonas caviae ATCC 15468 Bacillus megaterium  ATCC 14581    

Aeromonas hydrophila ATCC 35654 Bacillus megaterium FNCC    

Aeromonas hydrophila ATCC 49140 Bacillus polymyxa FNCC    

Aeromonas hydrophila ATCC 7965 Bacillus pumilus ATCC BAA-1434    

Aeromonas hydrophila ATCC 7966 Bacillus stearothermophilus ATCC 10149    

Aeromonas salmonicida ATCC 33658 Bacillus stearothermophillus FNCC    

Aeromonas veronii biogroup sobria ATCC 9071 Bacillus subtilis ATCC 6633    

Aggregatibacter aphrophilus ATCC 33389 Bacillus subtilis FNCC    

Agrobacterium tumefaciens FNCC Bacteroides fragilis ATCC 23745    

Alcaligenes faecalis ATCC 35655 Bacteroides fragilis ATCC 25285    

Alcaligenes faecalis subsp. Faecalis ATCC 8750 Bacteroides ovatus ATCC 8483    

Alcaligenes xylosoxydans subsp. denitrificans FNCC Bacteroides ovatus ATCC BAA-1296    

Alternaria alternata FNCC Bacteroides ovatus ATCC BAA-1304    

Alternaria alternata TX 8025 Bacteroides thetaiotaomicron ATCC 29741    

Aneurinibacillus aneurinolyticus ATCC 11376 Bacteroides uniformis ATCC 8492    

Arcanobacterium pyogenes ATCC 19411 Bacteroides ureolyticus ATCC 33387    

Arcanobacterium pyogenes ATCC 49698 Bacteroides vulgatus ATCC 8482    

Aspergillus awamori FNCC Bifidobacterium breve ATCC 15700    

Aspergillus brasiliensis ATCC 16404 Bordetella brochiseptica ATCC 10580    

Aspergillus brasiliensis ATCC 9642 Bordetella brochiseptica ATCC 4617    

Aspergillus candidus FNCC Bordetella pertussis ATCC 12742    

Aspergillus flavipes FNCC Bordetella pertussis ATCC 9340    

Aspergillus flavus FNCC Brevibacterium flavum FNCC    

Aspergillus fumigatus FNCC Brevibacterium lipolyticum FNCC    

Aspergillus fumigatus KM 8001 Brevibscillus agri ATCC 51663    

Aspergillus japonicus FNCC Brevibscillus laterosporus ATCC 64    

Aspergillus niger FNCC Brevundimonas diminuta ATCC 11568    

Aspergillus niveus FNCC Brevundimonas diminuta ATCC 19146    

Aspergillus ochraceus FNCC Brochothrix thermosphacta ATCC 11509    

Aspergillus orzaye ATCC 10124 Burkholderia cepacia ATCC 17765    

Aspergillus oryzae FNCC Burkholderia cepacia ATCC 25416    

Aspergillus parasiticus FNCC Burkholderia cepacia ATCC 25608    

Aspergillus punicius FNCC C    

Aspergillus restrictus FNCC Campylobacter coli ATCC 33559    

Aspergillus sojae FNCC Campylobacter coli ATCC 43478    

Aspergillus tamarii FNCC Campylobacter jejuni  ATCC 29428    

Campylobacter jejuni subsp. Jejuni ATCC 33291 Clostridium histolyticum ATCC 19401    

Campylobacter jejuni subsp. Jejuni ATCC 33292 Clostridium novyi ATCC 7659    

Candida albicans ATCC 10231 Clostridium novyi Type A ATCC 19402    

Candida albicans ATCC 14053 Clostridium septicum ATCC 12464    

Candida albicans ATCC 2091 Clostridium sordellii ATCC 9714    

Candida albicans ATCC 36232 Clostridium sporogenes ATCC 11437    

Candida albicans ATCC 60193 Clostridium sporogenes ATCC 19404    

Candida albicans ATCC 66027 Clostridium sporogenes ATCC 3584    

Candida albicans ATCC 90028 Clostridium tertium ATCC 19405    

Candida curvata FNCC Corynebacterium diphtheriae ATCC 13812    

Candida dubliniensis ATCC MYA-577 Corynebacterium glutanicum FNCC    

Candida geochares ATCC 36852 Corynebacterium hoagii FNCC    

Candida glabrata ATCC 15126 Corynebacterium jeikeium ATCC 43734    

Candida glabrata ATCC 2001 Corynebacterium minutissimum ATCC 23348    

Candida glabrata ATCC 66032 Corynebacterium pseudodiphhtheriticum ATCC 10700    

Candida glabrata ATCC MYA-2950 Corynebacterium pseudodiphhtheriticum ATCC 10701    

Candida guiliermondii ATCC 6260 Corynebacterium renale ATCC 19412    

Candida kefyr ATCC 204093 Corynebacterium renale ATCC BAA-1785    

Candida kefyr ATCC 2512 Corynebacterium striatum ATCC BAA-1293    

Candida kefyr ATCC 66028 Corynebacterium urealyticum ATCC 43044    

Candida kefyr FNCC Corynebacterium xerosis ATCC 373    

Candida krusei ATCC 14243 Cronobacter muytjensii ATCC 51329    

Candida krusei ATCC 34135 Cryptococcus albidus ATCC 66030    

Candida krusei FNCC Cryptococcus albidus var. Albidus ATCC 10666    

Candida lipolytica FNCC Cryptococcus albidus var. Albidus ATCC 34140    

Candida lusitaniae ATCC 34449 Cryptococcus curvatus FNCC    

Candida lusitaniae ATCC 42720 Cryptococcus humicolus ATCC 9949    

Candida lusitaniae ATCC 66035 Cryptococcus laurentii ATCC 18803    

Candida norvegensis FNCC Cryptococcus laurentii ATCC 66036    

Candida parapsilosis ATCC 22019 Cryptococcus laurentii ATCC 76483    

Candida parapsilosis ATCC 34136 Cryptococcus neoformans ATCC 14116    

Candida parapsilosis ATCC 90018 Cryptococcus neoformans ATCC 204092    

Candida tropicalis ATCC 1369 Cryptococcus neoformans ATCC 32045    

Candida tropicalis ATCC 201380 Cryptococcus neoformans ATCC 34877    

Candida tropicalis ATCC 66029 Cryptococcus neoformans ATCC 56991    

Candida tropicalis ATCC 750 Cryptococcus neoformans ATCC 66031    

Candida tropicalis FNCC Cryptococcus neoformans ATCC 76484    

Candida utilis ATCC 9950 Cryptococcus uniguttulatus ATCC 66033    

Candida utilis FNCC Curtobacterium pusillum ATCC 19096    

Candida wicherhamii FNCC Curvularia lunata FNCC    

Cellulosimicrobium cellulans ATCC 27402 Curvularia sp. KM 8023    

Chlamydomucor oryzae FNCC D    

Citrobacter braakii ATCC 10625 Debaryomyces hansenii FNCC    

Citrobacter diversus KM 11012 Debaryomyces polymorphus FNCC    

Citrobacter freundii ATCC 8090 E    

Cladosporium cladosporioides FNCC Edwardsiella tarda ATCC 15947    

Clostridium acetobutylicum FNCC Eggerthella lenta ATCC 43055    

Clostridium barati ATCC 27638 Eikenella corrodens ATCC 23834    

Clostridium difficile ATCC 43255 Eikenella corrodens ATCC BAA-1152    

Clostridium difficile ATCC 700057 Elizabethkingia meningoseptica ATCC 13253    

Clostridium difficile ATCC 9689 Enterobacter aerogenes ATCC 13048    

Clostridium difficile ATCC BAA-1870 Enterobacter aerogenes ATCC 35028    

Enterobacter aerogenes ATCC 35029 Fusarium longipes FNCC    

Enterobacter aerogenes ATCC 49071 Fusarium moniliforme FNCC    

Enterobacter cloacae ATCC 13047 Fusarium semitectum FNCC    

Enterobacter cloacae ATCC 23355 Fusarium solani FNCC    

Enterobacter cloacae ATCC 35030 Fusobacterium mortiferum ATCC 25557    

Enterobacter gergoviae ATCC 33028 Fusobacterium mortiferum ATCC 9817    

Enterobacter hormaechei ATCC 700323 Fusobacterium necrophorum ATCC 25286    

Enterococcus avium ATCC 14025 Fusobacterium nucleatumum ATCC 10953    

Enterococcus casseliflavus ATCC 700327 Fusobacterium nucleatumum subsp. Nucleatum ATCC 25586    

Enterococcus durans ATCC 11576 Fusobacterium oxysporum ATCC 48112    

Enterococcus durans ATCC 49135 G    

Enterococcus durans ATCC 49479 Gardnerella vaginalis ATCC 14018    

Enterococcus durans ATCC 6056 Gardnerella vaginalis ATCC 49145    

Enterococcus faecalis ATCC 19433 Gemella morbillorum ATCC 27824    

Enterococcus faecalis ATCC 29212 Geobacillus stearothermophilus ATCC 10149    

Enterococcus faecalis ATCC 49149 Geobacillus stearothermophilus ATCC 12978    

Enterococcus faecalis ATCC 49452 Geobacillus stearothermophilus ATCC 12980    

Enterococcus faecalis ATCC 51299 Geobacillus stearothermophilus ATCC 7953    

Enterococcus faecalis ATCC 7080 Geomyces pannorum FNCC    

Enterococcus faecalis ATCC 35667 Geotrichum candidum ATCC 34614    

Enterococcus faecalis ATCC 51559 Geotrichum candidum ATCC 10663    

Enterococcus faecalis ATCC 700221 Geotrichum candidum ATCC 28576    

Enterococcus gallinarum ATCC 700425 Geotricum candidum FNCC    

Enterococcus hirae ATCC 8043 Gordona rubropertinctus FNCC    

Enterococcus raffinosus ATCC 49464 Gordona terrae FNCC    

Enterococcus saccharolyticus ATCC 43076 H    

Epidermophyton floccosum ATCC 52066 Haemophilus aphrophilus ATCC 19415    

Erysipelothrix rhusiopathiae ATCC 19414 Haemophilus haemoglobinophilus ATCC 19416    

Escherichia coli ATCC 10536 Haemophilus haemolyticus ATCC 33390    

Escherichia coli ATCC 11229 Haemophilus influenzae ATCC 33930    

Escherichia coli ATCC 11775 Haemophilus influenzae ATCC 35056    

Escherichia coli ATCC 12014 Haemophilus influenzae ATCC 35540    

Escherichia coli ATCC 13706 Haemophilus influenzae ATCC 49144    

Escherichia coli ATCC 25992 Haemophilus influenzae ATCC 49247    

Escherichia coli ATCC 29194 Haemophilus influenzae ATCC 49766    

Escherichia coli ATCC 35218 Haemophilus influenzae ATCC 19418    

Escherichia coli ATCC 35421 Haemophilus influenzae NCTC 8468    

Escherichia coli ATCC 4157 Haemophilus influenzae Type a ATCC 9006    

Escherichia coli ATCC 51446 Haemophilus influenzae Type b ATCC 10211    

Escherichia coli ATCC 51755 Haemophilus influenzae Type b ATCC 33533    

Escherichia coli ATCC 8739 Haemophilus influenzae Type c ATCC 9007    

Esherichia coli FNCC Haemophilus parahaemolyticus ATCC 10014    

Eurotium amstelodami FNCC Haemophilus parainfluenzae ATCC 7901    

Eurotium chevalieri FNCC Haemophilus paraphrophilus ATCC 49146    

Eurotium rubrum FNCC Haemophilus paraphrophilus ATCC 49917    

Exiguobacterium aurantiacum ATCC 49676 I    

Exophiala jeanselmei ATCC 10224 Issatchenkia orientalis ATCC 6258    

F K    

Finegoldia magna ATCC 29328 Klebsiella pneumoniae C6    

Fluoribacter bozemanae ATCC 33217 Klebsiella oxytoca ATCC 13182    

Fluoribacter dumoffii ATCC 33279 Klebsiella oxytoca ATCC 43086    

Fonsecaesa pedrosoi ATCC 28174 Klebsiella oxytoca ATCC 49131    

Klebsiella oxytoca ATCC 700324 Listeria monocytogenes ATCC 7644    

Klebsiella oxytoca ATCC 8724 Listeria monocytogenes ATCC 7646    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 10031 Listeria monocytogenes ATCC BAA-751    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 13882 Lysinibacillus sphaericus ATCC 4525    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 13883 M    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 27736 Malassezia furfur ATCC 14521    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 33495 Malassezia furfur ST 8036    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 35657 Microbacterium liquefaciens ATCC BAA-1819    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 700603 Microbacterium paraoxydans ATCC BAA-1818    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC 9997 Microbacterium testaceum ATCC 15829    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC BAA 1705 Micrococcus luteus ATCC 10240    

Klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ATCC BAA 1706 Micrococcus luteus ATCC 4698    

Kloeckera apiculata var. Apis ATCC 32857 Micrococcus luteus ATCC 49732    

Kloeckera japonica ATCC 58370 Micrococcus lylae ATCC 27566    

Kluyveromyces lactis FNCC Micrococcus sp. ATCC 700405    

Kluyveromyces marxianus FNCC Microsporum canis ATCC 11621    

Kluyveromyces thermotolerans FNCC Monascus purpureus FNCC    

Kockovaella thailandica FNCC Moraxella catarrhalis ATCC 23246    

Kocuria kristiane ATCC BAA-752 Moraxella catarrhalis ATCC 25238    

Kocuria rhizophila ATCC 533 Moraxella catarrhalis ATCC 25240    

Kocuria rhizophila ATCC 9341 Moraxella catarrhalis ATCC 49143    

Kocuria rosea ATCC 186 Moraxella catarrhalis ATCC 8176    

L Moraxella osloensis ATCC 10973    

Lactobacillus acidophilus ATCC 314 Moraxella osloensis ATCC 19976    

Lactobacillus acidophilus ATCC 4356 Morganella morganii FNCC    

Lactobacillus acidophillus FNCC Morganella morganii subsp. morganii ATCC 25830    

Lactobacillus brevis ATCC 8287 Mucor plumbeus FNCC    

Lactobacillus brevis FNCC Mucor racemosus FNCC    

Lactobacillus bulgaricus FNCC Myroides odoratus ATCC 4651    

Lactobacillus casei ATCC 393 N    

Lactobacillus casei FNCC Neisseria gonorrhoeae ATCC 19424    

Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis ATCC 12315 Neisseria gonorrhoeae ATCC 31426    

Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii FNCC Neisseria gonorrhoeae ATCC 35541    

Lactobacillus fermentum FNCC Neisseria gonorrhoeae ATCC 43070    

Lactobacillus gasseri ATCC 19992 Neisseria gonorrhoeae ATCC 49226    

Lactobacillus paracasei subsp. paracasei ATCC BAA-52 Neisseria gonorrhoeae ATCC 49926    

Lactobacillus plantarum ATCC 8014 Neisseria gonorrhoeae ATCC 49981    

Lactobacillus plantarum FNCC Neisseria gonorrhoeae ATCC 43069    

Lactobacillus rhamnosus (Lactobacillus casei subsp. rhamnosus) FNCC Neisseria lactamica ATCC 23970    

Lactobacillus murinus FNCC Neisseria lactamica ATCC 23971    

Lactococcus lactis subsp. lactis FNCC Neisseria lactamica ATCC 49142    

Leclercia adecarboxylata ATCC 23216 Neisseria meningtidis serogroup C ATCC 13102    

Leclercia adecarboxylata ATCC 700325 Neisseria meningtidis serogroup A ATCC 13077    

Legionella pneumophila ATCC 33823 Neisseria meningtidis serogroup B ATCC 13090    

Legionella pneumophila ATCC 33152 Neisseria meningtidis serogroup Y ATCC 35561    

Leuconostoc mesenteroides ATCC 8293 Neisseria mucosa ATCC 19695    

Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides FNCC Neisseria perflava ATCC 14799    

Lipomyces starkeyi FNCC Neisseria sicca ATCC 29256    

Listeria grayi ATCC 25401 Neisseria sicca ATCC 9913    

Listeria innocua ATCC 33090 Neurospora sitophila FNCC    

Listeria innocua VC 32293 Nigrospora oryzae FNCC    

Nitrobacter winogradskyi FNCC Propionibacterium acidiproprionici ATCC 25562    

Nitrosomonas europaea FNCC Propionibacterium acnes ATCC 11827    

Nocardia asteroides CL 11014 Propionibacterium acnes ATCC 6919    

Nocardia asteroides FNCC Propionibacterium propionicus FNCC    

Nocardia brasiliensis ATCC 19296 Proteus hauseri ATCC 13315    

Nocardia brasiliensis ATCC 19297 Proteus mirabilis ATCC 12453    

Nocardia erythropolis FNCC Proteus mirabilis ATCC 25933    

Nocardia farcinica ATCC 3308 Proteus mirabilis ATCC 29245    

Nocardia farcinica FNCC Proteus mirabilis ATCC 29906    

O Proteus mirabilis ATCC 35659    

Ochrobactrum anthropi ATCC 49187 Proteus mirabilis ATCC 43071    

Ochrobactrum anthropi ATCC 49687 Proteus mirabilis ATCC 7002    

Ochrobactrum anthropi ATCC BAA-749 Proteus vulgaris ATCC 49132    

Oligella ureolytica ATCC 43534 Proteus vulgaris ATCC 6380    

Oligella urethralis ATCC 17960 Proteus vulgaris ATCC 8427    

P Prototheca wickerhamii ATCC 16529    

Paenibacillus gordonae ATCC 29948 Providencia alcalifaciens ATCC 51902    

Paenibacillus macerans ATCC 8509 Providencia stuartii ATCC 33672    

Paenibacillus polymyxa ATCC 43865 Providencia stuartii ATCC 49809    

Paenibacillus polymyxa ATCC 7070 Provotella melaninogenica ATCC 25845    

Paenibacillus polymyxa ATCC 842 Pseudomonas aeruginosa ATCC 10145    

Parabacteroides distasonis ATCC 8503 Pseudomonas aeruginosa ATCC 15442    

Parabacteroides distasonis ATCC BAA-1295 Pseudomonas aeruginosa ATCC 17934    

Parvimonas micra ATCC 33270 Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853    

Pasteurella aerogenes ATCC 27883 Pseudomonas aeruginosa ATCC 35032    

Pasteurella multocida subsp. multocida ATCC 43137 Pseudomonas aeruginosa ATCC 35422    

Pediococcus acidilactici FNCC Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027    

Pediococcus halophilus FNCC Pseudomonas aeruginosa ATCC 9721    

Pediococcus pentosaceus ATCC 33314 Pseudomonas aeruginosa ATCC BAA-1744    

Pediococcus pentosaceus FNCC Pseudomonas aeruginosa FNCC    

Penicillium brasilianum FNCC Pseudomonas cepacia FNCC    

Penicillium cammembertii FNCC Pseudomonas fluorescens ATCC 13525    

Penicillium candidum FNCC Pseudomonas fluorescens FNCC    

Penicillium chrysogenum ATCC 10106 Pseudomonas putida ATCC 49128    

Penicillium citrinum FNCC Pseudomonas putida FNCC    

Penicillium crustosum FNCC Pseudomonas stutzeri ATCC 17588    

Penicillium funiculosum FNCC R    

Penicillium glabrum FNCC Ralstonia pickettii ATCC 49129    

Penicillium oxalicum FNCC Rhizomucor miehei FNCC    

Penicillium pinophilum FNCC Rhizomucor pusillus FNCC    

Penicillium purpurogenum FNCC Rhizopus microsporus FNCC    

Penicillium roqueforti FNCC Rhizopus oligosporus FNCC    

Peptoniphilus asaccharolyticus ATCC 29743 Rhizopus oryzae FNCC    

Peptostreptococcus anaerobius ATCC 27337 Rhizopus stolonifer ATCC 14037    

Phialophora verrucosa ATCC 28181 Rhodococcus equi ATCC 6939    

Pichia burtonii FNCC Rhodococcus equi FNCC    

Pichia guilliermondii FNCC Rhodococcus erythropolis FNCC    

Pichia ohmeri FNCC Rhodococcus fascians FNCC    

Plesiomonas shigelloides ATCC 14029 Rhodococcus rhodochrous FNCC    

Plesiomonas shigelloides ATCC 51903 Rhodosporidium toruloides FNCC    

Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 Rhodotorula glutinis ATCC 32765    

Porphyromonas levii ATCC 29147 Rhodotorula glutinis FNCC    

S Sphingobacterium multivorum ATCC 35656    

Saccharomyces bayanus FNCC Sphingobacterium spiritivorum ATCC 33861    

Saccharomyces caribergensis FNCC Sphingomonas paucimobilis FNCC    

Saccharomyces cerevisiae ATCC 4098 Sporidiobolus salmonicolor ATCC MYA-4550    

Saccharomyces cerevisiae ATCC 9763 Sporothrix schenckii ATCC 10212    

Saccharomyces cerevisiae FNCC Staphylococcus aureus ATCC 29737    

Saccharomyces diastaticus FNCC Staphylococcus aureus ATCC 35548    

Saccharomyces kluyvery FNCC Staphylococcus aureus ATCC 9144    

Saccharomyces pastorianus FNCC Staphylococcus aureus ATCC BAA-1026    

Saccharomyces uvarum FNCC Staphylococcus aureus ATCC BAA-1708    

Saccharomycopsis fibuligera FNCC Staphylococcus aureus FNCC    

Salmonella choleraesuis subsp. choleraesuis FNCC Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 35661    

Salmonella enterica serovar Typhimurium ATCC 13311 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 12600    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum ATCC 9270 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 25178    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis ATCC 10708 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 25904    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis ATCC 13076 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 33592    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Montevideo ATCC 8387 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 49444    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport ATCC 6962 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 49476    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A ATCC 11511 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 51153    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B ATCC 8759 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 6538P    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi ATCC 6539 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 6538    

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium ATCC 14028 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC BAA-976    

Salmonella enterica sv Poona NCTC 4840 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC BAA-977    

Salmonella FNCC Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 25923    

Salmonella sp. Not Typhi group D BF-SD Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 29213    

Salmonella sp. Serovar Abony NCTC 6017 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 29247    

Salmonella tranoroa NCTC 10252 Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 33591    

Salmonella typhimurium FNCC Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 33862    

Schizosaccharomyces pombe FNCC Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 43300    

Scopulariopsis acremonium ATCC 58636 Staphylococcus epidermis ATCC 12228    

Serovar typhimurium FNCC Staphylococcus epidermis ATCC 14990    

Serratia liquefaciens ATCC 27592 Staphylococcus epidermis ATCC 29887    

Serratia marcescens ATCC 13880 Staphylococcus epidermis ATCC 49134    

Serratia marcescens ATCC 14756 Staphylococcus epidermis ATCC 49461    

Serratia marcescens ATCC 8100 Staphylococcus epidermis ATCC 700296    

Serratia odorifera ATCC 33077 Staphylococcus epidermis FNCC    

Shewanella putrefaciens ATCC 49138 Staphylococcus haemolyticus ATCC 29970    

Shewanella putrefaciens ATCC 8071 Staphylococcus hominis ATCC 27844    

Shigella sonei group D ATCC 11060 Staphylococcus lentus ATCC 700403    

Shigella sonei group D ATCC 25931 Staphylococcus lugdunensis ATCC 700328    

Shigella sonei group D ATCC 9290 Staphylococcus rafinolactis FNCC    

Shigella boydii serovar 1 group C ATCC 9207 Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305    

Shigella dysenteriae group A ATCC 13313 Staphylococcus saprophyticus ATCC 35552    

Shigella flexneri serovar 2b group B ATCC 12022 Staphylococcus saprophyticus ATCC 43867    

Staphylococcus saprophyticus ATCC 49453 Streptococcus pneumoniae ATCC 6303    

Staphylococcus saprophyticus ATCC 49907 Streptococcus pneumoniae ATCC 6305    

Staphylococcus saprophyticus ATCC BAA-750 Streptococcus pneumoniae CL 811    

Staphylococcus sciuri subsp. sciuri ATCC 29060 Streptococcus pyogenes ATCC 19615    

Staphylococcus sciuri subsp. sciuri ATCC 29061 Streptococcus pyogenes group A ATCC 12384    

Staphylococcus simulans ATCC 27851 Streptococcus pyogenes group A ATCC 21547    

Staphylococcus thermophillus FNCC Streptococcus salivarius serotype II ATCC 13419    

Staphylococcus xylosus ATCC 29967 Streptococcus sanguinis Type 1 ATCC 10556    

Staphylococcus xylosus ATCC 29971 Streptococcus sp. Gp D ATCC 9854    

Staphylococcus xylosus ATCC 35663 Streptococcus sp. group B ATCC 12401    

Staphylococcus xylosus ATCC 49148 Streptococcus sp. group D ATCC 27284    

Staphylococcus xylosus ATCC 700404 Streptococcus sp. Type 2 group F ATCC 12392    

Stenotrophomonas maltophilia ATCC 13637 Streptococcus thermophilus ATCC 19258    

Stenotrophomonas maltophilia ATCC 17666 Streptococcus uberis ATCC 700407    

Stenotrophomonas maltophilia ATCC 49130 Streptococcus uberis ATCC 9927    

Stenotrophomonas maltophilia ATCC 51331 Streptomyces albus ATCC 17900    

Streptococcus agalactiae group B ATCC 12386 Streptomyces griseus subsp. griseus ATCC 10137    

Streptococcus agalactiae group B ATCC 13813 T    

Streptococcus agalactiae group B CL 810 Tatlockia micdadei ATCC 33204    

Streptomyces ambofaciens FNCC Trichophyton equinum ATCC 12544    

Streptococcus bovis ATCC 33317 Trichophyton mentagrophytes ATCC 9533    

Streptococcus criceti ATCC 19642 Trichophyton robrum ATCC 28188    

Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis group G ATCC 12394 Trichophyton tonsurans ATCC 28942    

Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis ATCC 35666 Trichophyton verrucosum ATCC 42898    

Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis ATCC 9542 Trichophyton cultaneum ATCC 28592    

Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis group C ATCC 43079 Trichophyton mucoides ATCC 204094    

Streptococcus equi subsp. zooepidemicus group C ATCC 700400 V    

Streptococcus gallolyticus ATCC 49147 Veillonella parvula ATCC 10790    

Streptococcus gallolyticus ATCC 9809 Veillonella parvula ATCC 17745    

Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC 49475 Vibrio cholerae serotype Inaba ATCC 9459    

Streptococcus mutans ATCC 25175 Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802    

Streptococcus mutans ATCC 35668 Vibrio vulnificus ATCC 27562    

Streptococcus oralis ATCC 35037 Virgibacillus pantothenticus ATCC 14576    

Streptococcus oralis ATCC 9811 Y    

Streptococcus pasteurianus ATCC 49133 Yarrowia lipolytica ATCC 9773    

Streptococcus pneumoniae ATCC 27336 Yersinia enterocolitica ATCC 23715    

Streptococcus pneumoniae ATCC 49136 Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica ATCC 9610    

Streptococcus pneumoniae ATCC 49150 Yersinia kristensenii ATCC 33639    

Streptococcus pneumoniae ATCC 49619 Z    

Streptococcus pneumoniae ATCC 6301 Zygosaccharomyces bailii ATCC MYA-4549